Idag är det sannolikt att människor som vill skicka varor (eller flytta människor) inser att det inte alltid är vettigt att hålla sig till ett enda transportsätt. Till exempel kan lasten lossas från ett skepp till en lastbil, som överför den till en railyard, från vilken den kommer att flyttas över landet med tåg. Intermodal transport kan vara effektivare och billigare. i vissa fall har det dock uttalat nackdelar när det gäller hastighet och tillförlitlighet.
Fart
Även om intermodal transport ger fördelen med relativt låga kostnader jämfört med andra metoder, uppnår den detta genom att offra hastighet; När som helst lasten överförs till ett relativt långsammare reserätt, till exempel tåg, som arbetar på fasta skenor som inte kan erbjuda lika direkta vägar som de vägar en lastbil använder, saktar den sig. För att fungera vid högsta effektivitet måste intermodal transport också minska den tid som spenderas i depåer för att en ny operatör ska komma fram eller att lasten lossas.
Brist på tillförlitlighet
På grund av sitt beroende av mer än ett transportsätt är intermodal transport också föremål för lägre total tillförlitlighet. När kedjan av olika lägen växer, ökar också möjligheten att någon länk i kedjan bryts ner. Detta är särskilt problematiskt när ett av transportsätten är järnväg; järnvägar är mer mottagliga för förseningar som införs genom dåligt väder eller utrustningsfel. Av denna anledning, liksom bekymmer över hastighet, är avlastare som behöver pålitlig höghastighetstransport mindre benägna att överväga intermodala system.
Skada
När lasten måste blandas runt riskerar sjöfartare risken för skada då frakten överförs från en transportmetod till en annan. Lyckligtvis kan denna fara mildras, men det innebär att det i allmänhet innebär överpackning genom att lägga till mer häftande och skyddande material än vad som normalt anses vara tillräckligt. Denna extra vikt och kostnad motverkar delvis de fördelar som den intermodala transporten har när det gäller energieffektivitet och kostnad.
Höga infrastrukturkostnader
Den intermodala godstransporten lider också av relativt höga infrastrukturkostnader. Containerisering har sänkt kostnaden och svårigheten att transportera varor genom att standardisera sin form; Avlastare kan enkelt flytta samma container från ett skepp till ett tåg till en lastbil. Hantering av dessa behållare kräver emellertid att avlastare har tunga kranar och utrustning som är nödvändiga för att manipulera stora behållare; Denna infrastruktur kan inte existera på alla ställen, särskilt i utvecklingsländer.